La cooperativa tiene la siguiente estructura funcional:

El Consejo rector se encarga de la gestión del día a día de la cooperativa, de coordinar los trabajos de los diferentes equipos, de la comunicación interna y de velar por la sostenibilidad a largo plazo del proyecto.

Lo conforman 7 cooperativistas que son elegidos mediante votación en Asamblea General tras presentarse los candidatos entre el conjunto de cooperativistas.

Los equipos o comisiones van creándose y adaptándose a las necesidades de la cooperativa y del colegio. Cada cooperativista debe formar parte al menos de una de ellas. En la actualidad existen 15 equipos de trabajo que a continuación detallamos:

Acercándonos
Admisiones
Comunicación
Eventos
Financiación alternativa
Formación
Inglés
Inventario
Limpieza
Limpieza exteriores
Mantenimiento
Materiales
Montaña
Secundaria
Tecnología